Al actualizar Ubuntu, cual es mi sorpresa cuando al ejecutar Compiz Fusion Icon el sistema se queda como si nada, ningun iconito en la barra superior ni nada.... asi que investigando por internet encontre la solución y consiste en un simple comando que nos activa o desactiva los indicadores de miniaplicación, asi que vamos con el.
Para activar los indicadores de la miniaplicación solo debemos abrir un terminal y escribir:
gsettings set com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist "['all']"
Después solo tenemos que reiniciar la sesión y listo, si tenemos configuradado Fusion Icon para que arranque al inicio nos aparecera, y si no solo debemos ejecutarlo.
Si deseas desactivar los indicadores de la miniaplicacion solo debes escribir:
gsettings reset com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist
Espero que sirva para algo.
Un saludo.